Materiały z wykładów

Czy jest ktoś w posiadaniu materiałów z wykładu(slajdy) i by się chciał nimi podzielić?
Ewentualnie, może ktoś zna login/hasło do materiałow na stronie:
[link widoczny dla zalogowanych] ?

Post został pochwalony 0 razy

Ostatnio zmieniony przez piotrek90 dnia Sob 15:49, 07 Gru 2013, w całości zmieniany 1 raz

login: biola
hasło: BioInf_2013

Post został pochwalony 1 raz

Materiały i info z forum informatyki. Na początku odpowiedź Giaro na pytanie co może sie pojawić.

Giaro:

"Witam,

Wie Pan, tak na prawde duzo materialu nadajacego sie do kolokwium nie ma: kilka algorytmow do wykonania, ew. cos do policzenia, zwiazanego z rozumieniem probabil. modeli mutacji i wynikajacych z tego macierzy podobienstwa liter (wyklad 3b). Z algorytmow widze:
- skladanie sekwencji, 3 sposoby (odleglosc edycyjna, podbienstwa globalne i lokalne) - f. kary za przerwy raczej nie, bo tam potrzebne sa 3 macierze i zlozonosc za duza, by dalo sie wykonac na kartce w sensownym czasie,
- tworzenie i wycena (f. podobienstwa) wielodopasowan poprzez sklejanie pod-wielodopasowan sekwencji kolejno "za ich profile"
- filogeneza:
* model doskonalej filogenezy tj. sprawdzanie kompatybilnosci cech binarnych i skladanie z nich drzewa (cechy skierowane w czasie lub nie)
* model dystansowy (drzewo addytywne) i alg. NJ
* model parsymoniczny i alg. Fitcha.
* def. ogolnych pojec np. klastry, splity, drzewo konsensusu, transformacje np. NNI itp.

Nic wiecej mi teraz do glowy nie przychodzi, tego na prawde jest malo."

Materialy:
"
[link widoczny dla zalogowanych]
i trochę dawniejsze koła:
[link widoczny dla zalogowanych]
[link widoczny dla zalogowanych]
[link widoczny dla zalogowanych]
wraz z czyimś brudnopisem:
[link widoczny dla zalogowanych]
[link widoczny dla zalogowanych]

[link widoczny dla zalogowanych]

do zadania 5 to jest dobre ( tyle że trzeba w 5 kroku Dxu jeszcze podzielić przez 2) [link widoczny dla zalogowanych]

[link widoczny dla zalogowanych]
[link widoczny dla zalogowanych]

Zadania:

[link widoczny dla zalogowanych]
[link widoczny dla zalogowanych]

oraz poprawka

Zadanie 1 - 19 pkt - dystans edycyjny (czyli analogicznie jak w terminie podstawowym, tyle, że należało wybrać min zamiast max). W obu grupach wychodziło 12.

Zadanie 2 - 25 pkt - analogiczne jak zadanie 2 w terminie podstawowym. Dodatkowo prawidłowym przejściem było 1-1 2-2 i 3-3, więc wszystkie x* = x.

Zadanie 3 - 27pkt - przekształcenie zadania ze smurfami (zadanie 3 z terminu podstawowego). Model Cantora, prawdopodobieństwa itp dla 10mln lat i 5mln lat, podane alfa1 i alfa2 dla tych okresów czasu.

Zadanie 4 - 29pkt - filogeneza - do narysowania drzewo + drzewo konsensusu."

Post został pochwalony 1 raz

Ostatnio zmieniony przez AsiaJ dnia Czw 22:26, 06 Lut 2014, w całości zmieniany 1 raz

przyjmujemy, że onformacja o kartce ze wzorami jest aktualna?

Post został pochwalony 0 razy

Na infie utrzymuja ze tak. Poza tym na 2 przedmiotach ktore byly z giaro mozna bylo miec materialy + w zeszlym roku na tym samym przedmiocie pozwolil, wiec to raczej u niego norma.

Post został pochwalony 0 razy

Ostatnio zmieniony przez ufoq dnia Nie 18:58, 09 Lut 2014, w całości zmieniany 1 raz